Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL359076.1-201ENST00000426860 420 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
POLD1P28340 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
POLD1P28340 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
POLD1P28340 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
POLD1P28340 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms