Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 IKZF3-214ENST00000467757 1362 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC090559.2-201ENST00000366360 430 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 UST-AS1-201ENST00000413845 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC067904.3-201ENST00000617126 261 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RWDD1-204ENST00000487832 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HMGB1P1B2RPK0 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms