Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms