Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms