Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOD1Q9Y239 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms