Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC3Q9UQE7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms