Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PHF8Q9UPP1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF8Q9UPP1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms