Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNRGQ9UMZ2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms