Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms