Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms