Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIMS3Q9UJD0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms