Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPN3Q9UHW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms