Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms