Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRPC4Q9UBN4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms