Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-18Q9QC07 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms