Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXL2Q9NZ53 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXL2Q9NZ53 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms