Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C19orf12Q9NSK7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms