Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms