Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31BQ9NQW1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31BQ9NQW1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms