Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KIAA1549Q9HCM3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KIAA1549Q9HCM3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms