Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms