Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TDRD3Q9H7E2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD3Q9H7E2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms