Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SENP6Q9GZR1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP6Q9GZR1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms