Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms