Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTPBP4Q9BZE4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTPBP4Q9BZE4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms