Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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