Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD11Q9BXL7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms