Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM43Q9BTV4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms