Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDFIP1Q9BT67 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms