Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LARP6Q9BRS8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms