Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms