Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms