Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL13Q99616 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms