Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGMNQ99538 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms