Protein–RNA interactions for Protein: Q99359

RAD61, Protein RAD61, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAD61Q99359 YBL053WYBL053W 375 nt0.44□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 YOR102WYOR102W 351 nt0.44□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.42□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 MLP1YKR095W 5628 nt0.41□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 Q0032Q0032 291 nt0.41□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.41□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 snR39BsnR39B 96 nt0.41□□□□□ -2.34
RAD61Q99359 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.37□□□□□ -2.35
RAD61Q99359 MLP2YIL149C 5040 nt0.37□□□□□ -2.35
RAD61Q99359 RCO1YMR075W 2055 nt0.35□□□□□ -2.35
RAD61Q99359 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.34□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 YOR225WYOR225W 330 nt0.33□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.32□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 THO2YNL139C 4794 nt0.31□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.31□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.31□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.3□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 YBR099CYBR099C 384 nt0.28□□□□□ -2.36
RAD61Q99359 ESP1YGR098C 4893 nt0.28□□□□□ -2.37
RAD61Q99359 RPM2YML091C 3609 nt0.26□□□□□ -2.37
RAD61Q99359 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.26□□□□□ -2.37
RAD61Q99359 YLR294CYLR294C 330 nt0.25□□□□□ -2.37
RAD61Q99359 EST1YLR233C 2100 nt0.22□□□□□ -2.37
RAD61Q99359 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.21□□□□□ -2.38
RAD61Q99359 YNL205CYNL205C 423 nt0.2□□□□□ -2.38
RAD61Q99359 snR69snR69 101 nt0.17□□□□□ -2.38
RAD61Q99359 PMP2YEL017C-A 132 nt0.17□□□□□ -2.38
RAD61Q99359 SOM1YEL059C-A 225 nt0.15□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.15□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 SOV1YMR066W 2697 nt0.13□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.12□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.12□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 YGR164WYGR164W 336 nt0.11□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.11□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 SEC10YLR166C 2616 nt0.11□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.1□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.1□□□□□ -2.39
RAD61Q99359 RDS3YPR094W 324 nt0.09□□□□□ -2.4
RAD61Q99359 YNL266WYNL266W 420 nt0.08□□□□□ -2.4
RAD61Q99359 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.07□□□□□ -2.4
RAD61Q99359 snR128snR128 126 nt0.07□□□□□ -2.4
RAD61Q99359 YBR178WYBR178W 375 nt0.07□□□□□ -2.4
RAD61Q99359 snR45snR45 172 nt0.04□□□□□ -2.4
RAD61Q99359 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0□□□□□ -2.41
RAD61Q99359 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0□□□□□ -2.41
RAD61Q99359 snR50snR50 90 nt-0.02□□□□□ -2.41
RAD61Q99359 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.03□□□□□ -2.41
RAD61Q99359 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.03□□□□□ -2.41
RAD61Q99359 YNL170WYNL170W 396 nt-0.04□□□□□ -2.42
RAD61Q99359 ATP8Q0080 147 nt-0.08□□□□□ -2.42
RAD61Q99359 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.1□□□□□ -2.43
RAD61Q99359 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.11□□□□□ -2.43
RAD61Q99359 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.14□□□□□ -2.43
RAD61Q99359 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.16□□□□□ -2.44
RAD61Q99359 Q0092Q0092 141 nt-0.19□□□□□ -2.44
RAD61Q99359 snR67snR67 82 nt-0.2□□□□□ -2.44
RAD61Q99359 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
RAD61Q99359 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.22□□□□□ -2.44
RAD61Q99359 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.23□□□□□ -2.45
RAD61Q99359 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.25□□□□□ -2.45
RAD61Q99359 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.29□□□□□ -2.46
RAD61Q99359 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.29□□□□□ -2.46
RAD61Q99359 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.3□□□□□ -2.46
RAD61Q99359 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.3□□□□□ -2.46
RAD61Q99359 snR81snR81 201 nt-0.32□□□□□ -2.46
RAD61Q99359 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.32□□□□□ -2.46
RAD61Q99359 SKI7YOR076C 2244 nt-0.35□□□□□ -2.47
RAD61Q99359 snR61snR61 90 nt-0.37□□□□□ -2.47
RAD61Q99359 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.37□□□□□ -2.47
RAD61Q99359 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.37□□□□□ -2.47
RAD61Q99359 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.45□□□□□ -2.48
RAD61Q99359 Q0143Q0143 153 nt-0.46□□□□□ -2.48
RAD61Q99359 snR47snR47 99 nt-0.46□□□□□ -2.48
RAD61Q99359 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.48□□□□□ -2.49
RAD61Q99359 RPL41AYDL184C 78 nt-0.49□□□□□ -2.49
RAD61Q99359 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.49□□□□□ -2.49
RAD61Q99359 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.51□□□□□ -2.49
RAD61Q99359 snR161snR161 161 nt-0.58□□□□□ -2.5
RAD61Q99359 snR38snR38 95 nt-0.58□□□□□ -2.5
RAD61Q99359 URB1YKL014C 5295 nt-0.59□□□□□ -2.5
RAD61Q99359 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.6□□□□□ -2.51
RAD61Q99359 snR85snR85 171 nt-0.62□□□□□ -2.51
RAD61Q99359 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.64□□□□□ -2.51
RAD61Q99359 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.66□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.67□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 snR62snR62 100 nt-0.68□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.68□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 YMR326CYMR326C 309 nt-0.68□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 snR33snR33 183 nt-0.69□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 YKL225WYKL225W 348 nt-0.72□□□□□ -2.52
RAD61Q99359 YHR217CYHR217C 462 nt-0.74□□□□□ -2.53
RAD61Q99359 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
RAD61Q99359 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
RAD61Q99359 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
RAD61Q99359 YBL109WYBL109W 336 nt-0.78□□□□□ -2.53
RAD61Q99359 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.82□□□□□ -2.54
RAD61Q99359 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.93□□□□□ -2.56
RAD61Q99359 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
RAD61Q99359 YNR077CYNR077C 255 nt-0.94□□□□□ -2.56
RAD61Q99359 snR77snR77 88 nt-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 119.8 ms