Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms