Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGD4Q96M96 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms