Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX27Q96L92 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms