Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP47Q96K76 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms