Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGSM3Q96HU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM3Q96HU1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms