Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms