Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A4Q96EP9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms