Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL53Q96EL3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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MRPL53Q96EL3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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