Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C18orf8Q96DM3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms