Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC11Q96DB2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms