Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms