Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-CQ95604 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms