Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms