Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3AQ92664 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms