Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms